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Tel : 05.61.28.50.47
Mots clés :
-
Xanthomonas
-
Pathogénie
-
Immunité Végétale
Laurent Noël
Responsable de l'équipe SIX
Directeur d'unité et Directeur de Recherche CNRS
SIX
SUJETS DE RECHERCHE
-
Pathologie végétale
-
Immunité végétale
-
Microbiologie
-
Génétique moléculaire des plantes et des bactéries
-
Biologie moléculaire
FORMATION
-
1993-1996 : Magistère ENS Lyon
-
1995-1996 : DEA physiologie moléculaire et cellulaire végétale
-
1998-2001 : Doctorat Université Paris-Saclay
-
2007 : Habilitation à diriger les recherches, Université Aix-Marseille
FINANCEMENTS RECENTS
-
ANR NEPHRON (2018-2023) : développement, physiologie et immunité de l’hydathode
-
TULIP T3EX1 (2021) : reconnaissance des effecteurs de type III de Xanthomonas chez le chou et la tomate
COLLABORATIONS
-
Boris Szurek, IRD Montpellier, France
-
Laurent Deslandes, LIPME, Toulouse, France
-
Lionel Navarro, IBENS, Paris, France
-
Patrick Laufs, INRAE Versailles, France
-
Nathalie Leonhardt, BIAM, Cadarache, France
-
Jonathan Jacobs, OSU, Ohio
-
Adam Bogdanove, Cornell University, Ithaca, NY
-
Thomas Lahaye, Tübingen university, Allemagne
-
Sylvestre Marillonnet, IPB, Halle/Saale, Allemagne
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
LIENS
HOBBY
Voile habitable, menuiserie
Mots clés :
-
Xanthomonas
-
Virulence
-
HR
-
Système de sécrétion de type 3
-
Effecteurs
-
Genomique
Matthieu Arlat
Professeur Université Paul Sabatier - Toulouse III
SIX
SUJETS DE RECHERCHE
Génomique comparative chez les Xanthomonadaceae
FORMATION
Doctorat de l’Université Toulouse III, Paul Sabatier, 1989
COLLABORATIONS
Marie-Agnès Jacques, Martial Briand, IRHS Angers
ENSEIGNEMENT
-
Professeur de Microbiologie , Université Toulouse III, Paul Sabatier
-
L2 BCP/2B2M/BOPE : Microbiologie Générale
-
L3 2B2M : Microbiologie et Génétique Moléculaires
-
M1 Biotechnologie : Stratégie en Microbiologie, Diagnostic et Stratégie infectieuse
-
MEMBRE COMITE
-
Membre de la Commission Scientifique Sectorielle 2 (Sciences Biologiques et Médicales) de l’IRD
-
Membre élu au CA de l’Université Toulouse III, Paul Sabatier
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
ORCID: 0000-0001-6196-4856
LIENS
LIENS EXTERNES
HOBBY
-
Photographie
Tel: 05.61.28.50.47
Mots clés :
-
Xanthomonas
-
Pathogénie
-
Adaptation à l'hôte
Alice Boulanger
Maître de Conférence Université Paul Sabatier - Toulouse III
SIX
SUJETS DE RECHERCHE
J’ai, au cours de mon parcours, étudié les mécanismes et la régulation de la virulence de plusieurs modèles d’interactions hôte-pathogène (pathogènes végétaux at animaux).
Aujourd’hui, mon projet porte sur l’étude des déterminants génétiques de l'adaptation et de la pathogénie des pathogènes de plantes pendant l'infection, en exploitant les nouvelles perspectives offertes par les récentes technologies de type « Omiques ». Le projet porte sur la maladie de la pourriture noire des Brassicacées causée par le pathogène vasculaire Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc).
FORMATION
2023: Habilitation à Diriger la Recherche (HDR)
Université Paul Sabatier, Toulouse III.
2009 : Doctorat, Interactions Plantes-Microorganismes
Université Paul Sabatier, Toulouse III.
2005 : Master Analyse fonctionnelle des génomes, spécialité microorganismes
Université Paul Sabatier, Toulouse III.
FINANCEMENTS RECENTS
ANR XBOX (2020-2024) : L’étoffe d’un pathogène : comment Xanthomonas s’adapte à la vie in planta.
COLLABORATIONS
-
Adam Deutschbauer, Université de Californie, Berkeley, USA.
-
Jennifer Lewis, Université de Californie, Berkeley, USA .
-
Caroline Baroukh, LIPME, INRAE, Auzeville, FRANCE.
ENSEIGNEMENT
Maître de conférences à l’université Paul Sabatier UT3.
Mon activité d’enseignement se situe principalement dans le domaine de la microbiologie au niveau Licence 2 et Licence 3. Je suis responsable d'une UE de microbiologie générale communes aux deux parcours d'enseignement BCP et 2B2M regroupant environ 500 étudiants de Licence 2 à l’université Paul Sabatier. Je me suis également impliqué dans le Master international associé à cette EUR (TULIP-GSR).
MEMBRE COMITE
Membre du conseil pédagogique TULIP (2016-2024)
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
HOBBY
Escalade
AUTRES AFFILIATION
American Society of Microbiology (ASM)
Tel : 05.61.28.50.47
Mots clés :
-
Xanthomonas
-
Effecteurs TAL
-
Transporteur SWEET
-
Nervation noire
-
Chou
Corinne Audran
Chargée de Recherche INRAE
SIX
SUJETS DE RECHERCHE
Mon projet s’inscrit dans l’étude des Effecteurs de Type 3 (ET3) qui sont des protéines bactériennes injectées dans les cellules de la plante par les systèmes de sécrétion de type 3. Les ET3 manipulent la physiologie de la plante hôte à la fois pour supprimer l’immunité ou pour modifier la physiologie de la plante. En particulier, je cherche à comprendre le fonctionnement de gènes de sensibilité des Brassicacées dont l’expression est activée par des ET3 particuliers appelés TALEs (Transcription-Activator-Like Effector). Ce projet vise à élucider les mécanismes moléculaires de sensibilité à Xcc avec l’objectif, à long terme, d’identifier de nouvelles sources de résistance à la nervation noire par perte de sensibilité.
FORMATION
Habilitation à Diriger la Recherche (HDR), Université de Toulouse.
Thèse de doctorat de l’Université Paris Sud-Orsay (Paris XI)
FINANCEMENTS RECENTS
2021-2023 : Financement d’un contrat doctoral (BAP INRAE/ LIPME)
COLLABORATIONS
-
Boris Szurek, IRD Montpellier, France
-
Adam Bogdanove, Cornell University, Ithaca, USA
-
Thomas Lahaye, Tübingen University, Allemagne
-
Rozenn Le Hir, INRAE Versailles, France
ENSEIGNEMENT
Interactions symbiotiques et pathogènes, Master II ADAM, Université de Toulouse
TICaBM « TechnIques et Champs d’application de la Biologie Moléculaire », Licence 3, BCP, Université de Toulouse.
MEMBRE COMITE
-
Membre du conseil scientifique de l'école doctorale SEVAB
-
Membre du comité de suivi des doctorants du LIPME
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Tel : 05.61.28.50.47
Mots clés :
-
Microbiologie moléculaire
-
Phytopathologie
-
Xanthomonas
-
Interactions moléculaires
Carlos Andrés Zarate Chaves
Chargé de Recherche INRAE
SIX
SUJETS DE RECHERCHE
Les plantes interagissent en permanence avec une vaste gamme de micro-organismes, mais seule une petite fraction d'entre eux provoque des maladies. Cela soulève la question suivante : qu'est-ce qui définit un pathogène ? L'objectif principal de ma recherche est de résoudre l'une des énigmes majeures de la phytopathologie, à savoir la base génétique de la spécificité d'hôte, et de répondre à certaines questions, telles que : combien de gènes effecteurs sont nécessaires à la pathogénicité sur une plante donnée ?
Les règles définissant le fonctionnement des répertoires de gènes effecteurs (effectomes) diffèrent-elles entre les plantes hôtes et non-hôtes ?
Les effectomes peuvent-ils définir le spectre d'hôtes d'un pathogène ?
Les effectomes et l'immunité de l'hôte co-évoluent-ils ?
FORMATION
-
MÉCANISMES INTERACTIFS DES PATHOGÈNES PARASITES ET DES SYMBIONTES – Thèse de doctorat à l'Université de Montpellier / Institut de Recherche pour le Développement
-
MICROBIOLOGIE MOLÉCULAIRE – Études de Master (M2) à l'Universidad de los Andes
-
AGROBIOTECHNOLOGIE – Études de Master (M1) à l'Universidad Pública de Navarra
-
MICROBIOLOGIE INDUSTRIELLE – Études de Licence à la Pontificia Universidad Javeriana
FINANCEMENTS RECENTS
-
Projet OCCIPHAGE dans le cadre du défi clé OCTAAVE OCCITANIE.
COLLABORATIONS
-
Laboratorio De Interacciones Moleculares De Microorganismos En Agricultura – LIMMA, Université de los Andes, Colombie.
-
Manihot Biotec group, Université Nationale de Colombie, Colombie.
-
Phytopathology Laboratory, Pontificia Universidad Catolica del Ecuador, Equateur.
-
XPLAIN group, Plant Health Institut of Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement, France
-
Virostyle group, MIVEGEC, Institut de Recherche pour le Développement, France.
ENSEIGNEMENT
Tps en biologie cellulaire, Université de los Andes, Colombie
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
SCIENCE & SOCIETE
-
Zárate-Chaves CA. Comment les plantes se protègent-elles contre les maladies ? The conversation https://theconversation.com/comment-les-plantes-se-protegent-elles-contre-les-maladies-223517#:~:text=La%20plante%20r%C3%A9agit%20en%20mettant,envahisseur%2C%20emp%C3%AAchant%20ainsi%20la%20maladie.
HOBBY
Lindy hop
Membre de la Commission de Recherche au sein de l’Université de Toulouse III Paul Sabatier
Carine Gris
Assistante Ingénieur CNRS
SIX
Tel : 05.61.28.50.47
Tel : 05.61.28.50.47
Jean-Marc Routaboul
Ingénieur de Recherche
SIX
SUJETS DE RECHERCHE
Les hydathodes sont des ouvertures sur la marge des feuilles de la plupart des plantes qui libèrent de l'eau pendant le processus connu sous le nom de guttation. Mon intérêt actuel est de déchiffrer le rôle des hydathodes, notamment dans l'immunité des plantes, en combinant la transcriptomique, la génomique fonctionnelle et la physiologie.
Les hydathodes ressemblent à des stomates et, jusqu'à récemment, ils étaient très peu étudiés par rapport à leurs voisins plus connus qui contrôlent les échanges gazeux (Perrin, 1970). Cependant, les hydathodes abritent de nombreuses fonctions biologiques qui sont également importantes pour l'ensemble de la plante (Cerutti et al., 2017, 2019). Lorsque les stomates sont fermés, pendant la nuit par exemple, l'excès d'eau est déchargé par cet organe.
Les hydathodes sont des voies d'infection potentielles d'un nombre croissant de microbes nuisibles, dont celui qui provoque la pourriture noire sur les brassicacées comme Arabidopsis et le chou-fleur, Xanthomonas campestris pv. Campestris.
FORMATION
Après un doctorat en biologie végétale obtenu à Grenoble en 1991, j'ai travaillé sur la plante modèle Arabidopsis en utilisant une combinaison d'approches de génomique fonctionnelle, de métabolomique et de génétique quantitative. J'ai rejoint le groupe de J. Browse à l'Université d'Etat de Washington en 1994 pour étudier pendant quatre ans le rôle des acides gras polyinsaturés des plantes pour la tolérance aux stress du froid et de la chaleur. Je suis ensuite allé dans le groupe de C. Benning à l'IGF-Berlin pendant un an et j'ai continué ce travail de 1998 à 2001 dans l'équipe de L. Lepiniec à l'INRA de Versailles où il a été parmi les premiers à cloner le gène DAGAT dont le produit catalyse la dernière étape de la synthèse de l'huile (et de la graisse). J'ai été embauché à l'INRA en 2003 comme ingénieur de recherche à plein temps dans le groupe de L. Lepiniec. J'y ai développé plusieurs projets portant sur la synthèse des flavonoïdes dans les graines d'Arabidopsis notamment sur l'identification chimique de ces métabolites encore peu étudiés et sur les bases génétiques de leur variabilité. De 2012 à 2018, j'ai rejoint Toulouse et une autre plante modèle la tomate pour me concentrer sur le mécanisme moléculaire conduisant au développement de la chair du fruit au sein du laboratoire Génomique et Biologie du Fruit.
COLLABORATIONS
Gregory Mouille, Gilles Clément, INRAE, Versailles, France
Vincent Burlat, Alain Jauneau, LRSV, Toulouse, France
Lionel Navarro, IBENS, Paris, France
Patrick Laufs, INRAE Versailles, France
Nathalie Leonhardt, BIAM, Cadarache, France
Jonathan Jacobs, OSU, Ohio
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
ORCID:0000-0003-2197-5280
Tel : 05.61.28.50.47
Mots clés :
-
Aquaporine
-
Eau
-
HIR
-
PIP
Wahler Nicolas
Assistant Ingénieur
SIX
SUJETS DE RECHERCHE
Rôle des protéines HIR et PIP dans l'immunité pré- et post-invasive chez Arabidopsis thaliana.
Dans le cadre du projet ANR HIRAQIM, je contribue en tant qu’assistant·ingénieur·à un sujet de recherche portant sur le rôle des protéines HIR et des aquaporines PIP dans l’immunité des plantes contre des bactéries pathogènes telles que Pseudomonas syringae et Xanthomonas campestris. L’étude vise à déterminer l’importance relative du transport d’eau et du peroxyde d’hydrogène (H2O2) dans le mésophylle, durant les phases pré‐ et post‐invasives de l’infection.
FORMATION
BTS biotechnomogie
L3Pro EVAPPMT
LOISIRS
Anciens Membres
Doctorantes -Doctorants
Brice Charleux - 2021/2024
Thomas Quiroz Monnens - 2021/2024
Noe Arroyo Velez - 2018/2021
Caroline Bellenot - 2019/2022
Chercheuses- Chercheurs
Emmanuelle Lauber - 2004/2024
Tel : 05.61.28.50.47
Soline Marty
Doctorante
SIX
Les plantes mettent en place des réponses immunitaires complexes à même de contrôler la multiplication de la plupart des microbes qu’elles rencontrent. S’il est bien décrit que l’humidité est un des facteurs favorisant la propagation des maladies des plantes, les mécanismes moléculaires sous-jacents sont hypothétiques. Mon projet de thèse a pour but de déterminer dans quelle mesure le contrôle des flux d’eau apoplastique fait partie intégrante de l’immunité d’Arabidopsis et identifier les déterminants génétiques de Xanthomonas permettant à cette bactérie pathogène de manipuler les flux d’eau durant l’infection.
2021-2023 : Master Biologie Agrosciences parcours Interactions Plantes Microorganismes à l’université de Montpellier
SUJETS DE RECHERCHE
FORMATION